RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa12.81□□□□□ -0.36
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PTPRU-201ENST00000345512 GTF3C1Q12789 2109 aa12.75□□□□□ -0.37
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PTPRU-201ENST00000345512 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRU-201ENST00000345512 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRU-201ENST00000345512 NPPCP23582 126 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-201ENST00000345512 PMCHL2Q9BQD1 86 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-201ENST00000345512 Q9H3A6 140 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV1-46P01743 117 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-201ENST00000345512 S100A4P26447 101 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-201ENST00000345512 OR10AG1Q8NH19 301 aa12.74□□□□□ -0.37
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