RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 PAX1P15863 534 aa13.52□□□□□ -0.25
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SH3BP4-201ENST00000344528 COL4A6Q14031 1691 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 H0YIZ8 118 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NPFFO15130 113 aa13.51□□□□□ -0.25
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SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf54Q6X4T0 127 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ERASQ7Z444 233 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 REC114Q7Z4M0 266 aa13.49□□□□□ -0.25
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SH3BP4-201ENST00000344528 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.49□□□□□ -0.25
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SH3BP4-201ENST00000344528 KCNS1Q96KK3 526 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 USF3Q68DE3 2245 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa13.48□□□□□ -0.25
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SH3BP4-201ENST00000344528 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087WWC5 75 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS2P07478 247 aa13.47□□□□□ -0.25
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SH3BP4-201ENST00000344528 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.47□□□□□ -0.25
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SH3BP4-201ENST00000344528 EPDR1Q9UM22 224 aa13.46□□□□□ -0.25
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SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM190Q8WZ59 177 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10W1Q8NGF6 305 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A16P16260 332 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM155Q4W5P6 130 aa13.45□□□□□ -0.26
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SH3BP4-201ENST00000344528 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 LEMD1Q68G75 181 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 COQ2Q96H96 371 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SCN8AQ9UQD0 1980 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf71A4D174 169 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM101Q96IK0 257 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5LO75964 103 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL23P62829 140 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
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