RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 ZNF90Q03938 601 aa14.21□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 RHEBQ15382 184 aa14.21□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 THAP8Q8NA92 274 aa14.21□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.21□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TMEM11P17152 192 aa14.21□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.21□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.21□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.21□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 FUT9Q9Y231 359 aa14.21□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.2□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 C11orf94C9JXX5 98 aa14.2□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 NPFFO15130 113 aa14.2□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 GCHFRP30047 84 aa14.2□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.2□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 MT-CO2P00403 227 aa14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ATP5G3P48201 142 aa14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 CST9LP1Q5W188 147 aa14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF727A8MUV8 499 aa14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 DOK5Q9P104 306 aa14.19□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 PSMB11A5LHX3 300 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 COLCA2A8K830 154 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TMEM250H0YL14 139 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 CORTO00230 105 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR5G3P0C626 314 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 CTRB1P17538 263 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 CX3CL1P78423 397 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ISOC2Q96AB3 205 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.18□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 FAM106CPP0CH98 169 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 NPPCP23582 126 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 NANPQ8TBE9 248 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 I3L2K1 104 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 COL8A1P27658 744 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 PATE2Q6UY27 113 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 PARLQ9H300 379 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 BRS3P32247 399 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 NDPQ00604 133 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 MORN5Q5VZ52 161 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 Q8N9W7 124 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR4X1Q8NH49 305 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF503Q96F45 646 aa14.16□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 PAX1P15863 534 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ARPC1AQ92747 370 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TRGV9Q99603 122 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 ABCA1O95477 2261 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 COX7A2P2O60397 106 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 SELENOTP62341 195 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 TUBA4BQ9H853 241 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 NAT8Q9UHE5 227 aa14.15□□□□□ -0.14
ACTB-201ENST00000331789 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.14□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 IGHV1-69P01742 117 aa14.14□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.14□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.14□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.14□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 PDE6DO43924 150 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 OR7C2O60412 319 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 CLN5O75503 358 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 OR2C1O95371 312 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 C8orf88P0DMB2 117 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 DSCR9P59020 149 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-9P60411 292 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 UHRF2Q96PU4 802 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 C1RLQ9NZP8 487 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 LRRK2Q5S007 2527 aa14.13□□□□□ -0.15
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