RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 CD1BP29016 333 aa17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM200BQ69YZ2 307 aa17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 SSX8Q7RTT4 187 aa17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 IL3RAP26951 378 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR10X1Q8NGY0 326 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDB2Q92466 427 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM242Q9NWH2 141 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPL23P62829 140 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 RTL8BQ17RB0 113 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADTRPQ96IZ2 230 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRBAP50851 2863 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PGPEP1LA6NFU8 196 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLRB1Q12918 225 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTDSP1Q9GZU7 261 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBXL7Q9UJT9 491 aa17.11■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 C17orf112F2Z3M2 114 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CBLN1P23435 193 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 GATAD1Q8WUU5 269 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 AKAP6Q13023 2319 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF439Q8NDP4 499 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 NTF3P20783 257 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CA7P43166 264 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 LCN12Q6JVE5 192 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR4F5Q8NH21 305 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR4F4Q96R69 305 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF586Q9NXT0 402 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAT8Q9UHE5 227 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACACBO00763 2458 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 IFNA1P01562 189 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CT45A6P0DMU7 189 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CT45A5P0DMU8 189 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CT45A7P0DMV0 189 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 COMPP49747 757 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 MBD3L1Q8WWY6 194 aa17.09■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa17.08■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 GAGE12BA1L429 117 aa17.08■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFAP161Q6P656 301 aa17.08■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 NIT1Q86X76 327 aa17.08■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 MUC15Q8N387 334 aa17.08■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM216AQ8WUB2 273 aa17.08■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTSZQ9UBR2 303 aa17.08■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR51B2Q9Y5P1 312 aa17.08■□□□□ 0.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 C15orf61A6NNL5 157 aa17.08■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGLC2P0DOY2 106 aa17.08■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGLC3P0DOY3 106 aa17.08■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 GCSAMLQ5JQS6 135 aa17.08■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 TIMM9Q9Y5J7 89 aa17.08■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 FCN3O75636 299 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIAA1644Q3SXP7 199 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMIM12Q96EX1 92 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC45A2Q9UMX9 530 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 B9A039 149 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOMM40O96008 361 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 APOA2P02652 100 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 CRISP2P16562 243 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR1N2Q8NGR9 330 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 SSMEM1Q8WWF3 244 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 MED13LQ71F56 2210 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 J3QR06 171 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 AMTP48728 403 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 DLX1P56177 255 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM19A2Q8N3H0 131 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 WASHC3Q9Y3C0 194 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A1W2PPV4 95 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPY1RP25929 384 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPOP30536 169 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNIP4Q6PIL6 250 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 HARBI1Q96MB7 349 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDSNQ15517 529 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR4B1Q8NGF8 309 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLEKHA3Q9HB20 300 aa17.06■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 LY6DQ14210 128 aa17.05■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa17.05■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR52E5Q8NH55 327 aa17.05■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 ITPR1Q14643 2758 aa17.05■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 CACNA1AO00555 2505 aa17.05■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLXNB1O43157 2135 aa17.05■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa17.05■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMAGPQ0VAQ4 97 aa17.05■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 PKD1L2Q7Z442 2459 aa17.04■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 PSMB3P49720 205 aa17.04■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPOXP50336 477 aa17.04■□□□□ 0.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms