RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BKO60814 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PAGE4O60829 102 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TRGC2P03986 189 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BJP06899 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 MSMBP08118 114 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCL1P09341 107 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CGB3P0DN86 165 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CGB7P0DN87 165 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BOP23527 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 IL3RAP26951 378 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BBP33778 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BDP58876 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R45P59539 299 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 B2MP61769 119 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BCP62807 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 LCN2P80188 198 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 FBLN7Q53RD9 439 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CST9LP1Q5W188 147 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF343Q6P1L6 599 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SSX7Q7RTT5 188 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 LYG1Q8N1E2 194 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 DDB2Q92466 427 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ACY3Q96HD9 319 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOVQ96L33 236 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GAFA1Q96PS6 74 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GCM1Q9NP62 436 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TNCP24821 2201 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PN81 502 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPE3 182 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1D-33P01593 117 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1-33P01594 117 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV1-46P01743 117 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4A8P0C604 315 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TRGC1P0CF51 173 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 STAG3L2P0CL84 134 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 STAG3L3P0CL85 134 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFB7P17568 137 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNA7P36544 502 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PPOXP50336 477 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ADIPOQQ15848 244 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINK9Q5DT21 86 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4A47Q6IF82 309 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5B3Q8NH48 314 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4A5Q8NH83 315 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB1BQ9H0U4 201 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 BET1LQ9NYM9 111 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PPIAL4EA0A075B759 164 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf100A8MU93 164 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PPIAL4DF5H284 164 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 J3QR06 171 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 UPK2O00526 184 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFB3O43676 98 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 YIF1AO95070 293 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TFF1P04155 84 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TYMSP04818 313 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms