RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 TMEM105Q8N8V8 129 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TSKUQ8WUA8 353 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TRGV9Q99603 122 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 PRADC1Q9BSG0 188 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 DUTP33316 252 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 PAX8Q06710 450 aa6□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 C3orf36Q3SXR2 165 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 GPHA2Q96T91 129 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 PSG8Q9UQ74 426 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TMEM8BA6NDV4 472 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 HIGD1CA8MV81 97 aa6□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 CKS1BP61024 79 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 VWCEQ96DN2 955 aa6□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 RHOGP84095 191 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TMEM95Q3KNT9 176 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 ZNHIT1O43257 154 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 APOMO95445 188 aa5.99□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 ID3Q02535 119 aa5.99□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.99□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 A8MWV9 139 aa5.99□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 PROB1E7EW31 1015 aa5.99□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZS49 121 aa5.99□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 TMEM238C9JI98 176 aa5.98□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 ITGB1BP1O14713 200 aa5.98□□□□□ -1.45
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CPS1-201ENST00000233072 PLNP26678 52 aa5.98□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 HSD52Q0P140 79 aa5.98□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 EFNB3Q15768 340 aa5.98□□□□□ -1.45
CPS1-201ENST00000233072 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.98□□□□□ -1.45
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