RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768		Q9H521	79 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	PARP11	Q9NR21	331 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	GNG12	Q9UBI6	72 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	JPT1	Q9UK76	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	RAB22A	Q9UL26	194 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768		A0A075B6Q4	140 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM235	A6NFC5	223 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768		H0YJW9	148 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	PDCD5	O14737	125 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	IFNA5	P01569	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV1-16	P04430	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CT45A6	P0DMU7	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	MYL9	P24844	172 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CD1B	P29016	333 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	SOX6	P35712	828 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	NCS1	P62166	190 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	MOB3B	Q86TA1	216 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC190	Q86UF4	302 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	TPRA1	Q86W33	373 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF383	Q8NA42	475 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	SETD6	Q8TBK2	473 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	PTX4	Q96A99	478 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	GALM	Q96C23	342 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	RAB3C	Q96E17	227 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	MS4A10	Q96PG2	267 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	S1PR3	Q99500	378 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	RNF150	Q9ULK6	438 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	SSR3	Q9UNL2	185 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768		A0A087WXM4	84 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	TRDC	B7Z8K6	153 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	FCN1	O00602	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	ITGB1BP1	O14713	200 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	BET1	O15155	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	FABP7	O15540	132 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	AIRE	O43918	545 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFA3	O95167	84 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	MOS	P00540	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV2-23	P01705	113 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768		P0C879	139 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	ZP3	P21754	424 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CEACAM6	P40199	344 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	PSMD7	P51665	324 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	VBP1	P61758	197 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	RNF212	Q495C1	297 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	ZFP69	Q49AA0	526 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	CDNF	Q49AH0	187 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	HACD4	Q5VWC8	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768		Q6ZS49	121 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	OR4A5	Q8NH83	315 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	RDH8	Q9NYR8	311 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA2	Q9UM82	520 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	TXNL1	O43396	289 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	GABARAP	O95166	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MLH1-223	ENST00000616768	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87

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