RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601471.1

LINC00649-212, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-212ENST00000601471 SPCS3P61009 180 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 Q8N1Y9 231 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 GPR146Q96CH1 333 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 TXN2Q99757 166 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 PRR13Q9NZ81 148 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CACNG5Q9UF02 275 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 OR2T8A6NH00 312 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 A8MZ25 164 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 NDUFB6O95139 128 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 IFNA17P01571 189 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CTSGP08311 255 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 ANXA3P12429 323 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 FOLR2P14207 255 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 AKR1C4P17516 323 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SPINK9Q5DT21 86 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 TRIQKQ629K1 86 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 LCN12Q6JVE5 192 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 LGI3Q8N145 548 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 RYR3Q15413 4870 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CORTO00230 105 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 NDUFA4O00483 81 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 PITX3O75364 302 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 MT-CO2P00403 227 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CBLN1P23435 193 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CCR6P51684 374 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 PPP1R1AQ13522 171 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 PLET1Q6UQ28 207 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 MARC2Q969Z3 335 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 OR10C1Q96KK4 312 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 MLXQ9UH92 298 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 A0A1B0GU03 582 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 C15orf62A8K5M9 175 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 PLA2G10O15496 165 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SFT2D2O95562 160 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 LY86O95711 162 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SLC25A6P12236 298 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SNCAP37840 140 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 HTR2BP41595 481 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 TNFRSF9Q07011 255 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 SMCO1Q147U7 214 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 C2orf83Q53S99 150 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 MISP3Q96FF7 219 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 CCDC32Q9BV29 185 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 PALMDQ9NP74 551 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF320A2RRD8 509 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF785A8K8V0 405 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 K7EMT4 169 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 INPP1P49441 399 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 MFAP4P55083 255 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 CD69Q07108 199 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 TM4SF20Q53R12 229 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 Q56UQ5 140 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00649-212ENST00000601471 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms