RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 C5orf51A6NDU8 294 aa6.08□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.08□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.08□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1D-39P04432 117 aa6.08□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.08□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 OR4F4Q96R69 305 aa6.08□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01548A6NM66 108 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 SYNGR2O43760 224 aa6.05□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 CD28P10747 220 aa6.05□□□□□ -1.44
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