RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 PRNDQ9UKY0 176 aa9.44□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 MT-CO2P00403 227 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 CBX5P45973 191 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 BORCS5Q969J3 196 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 TXN2Q99757 166 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 VSIRQ9H7M9 311 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 IFT46Q9NQC8 304 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 DIABLOQ9NR28 239 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.43□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1B0GVY2 172 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 ST8SIA3O43173 380 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 XRCC3O43542 346 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 GNG7O60262 68 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 DFFBO76075 338 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 PMP2P02689 132 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF114Q8NC26 417 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 FCGR1BQ92637 280 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 HRH4Q9H3N8 390 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.42□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 C11orf94C9JXX5 98 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 GPR31O00270 319 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 IGKV1-39P01597 117 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 IGKV1D-39P04432 117 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 HLA-DMBP28068 263 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 PAFAH1B2P68402 229 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 Q6ZTC4 211 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 SEC22AQ96IW7 307 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 TSC22D3Q99576 134 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 GINS3Q9BRX5 216 aa9.41□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1B0GU03 582 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 NAT1P18440 290 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 C4BPBP20851 252 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 PRCDQ00LT1 54 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 STHQ8IWL8 128 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 X6R8D5 127 aa9.4□□□□□ -0.9
FCHO1-220ENST00000597474 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 CD5P06127 495 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 SPINK9Q5DT21 86 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 RABAC1Q9UI14 185 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 CELA1Q9UNI1 258 aa9.39□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 KNCNA6PVL3 124 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 K7EQG2 157 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 MIFP14174 115 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 HRH1P35367 487 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 TGFBR1P36897 503 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 TAS2R46P59540 309 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 TAS2R20P59543 309 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 NEDD8Q15843 81 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 OR4A16Q8NH70 328 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 TMEM50AO95807 157 aa9.37□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF688P0C7X2 276 aa9.37□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 HLA-DMAP28067 261 aa9.37□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.37□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.37□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.37□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.37□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 NACAE9PAV3 2078 aa9.36□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 RTL8CO15255 209 aa9.36□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 SPP1P10451 314 aa9.36□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 NPBWR1P48145 328 aa9.36□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 PPP5CP53041 499 aa9.36□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.36□□□□□ -0.91
FCHO1-220ENST00000597474 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms