RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 Q8NAQ8 132 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 ST8SIA2Q92186 375 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 GINS3Q9BRX5 216 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 VSIRQ9H7M9 311 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 APLNQ9ULZ1 77 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 PKHD1P08F94 4074 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAH2Q9P225 4427 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLL5B9A064 214 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 C11orf94C9JXX5 98 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 ST8SIA3O43173 380 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 GNG7O60262 68 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-48P01763 117 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 NAT1P18440 290 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R46P59540 309 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB131AP59861 70 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 PRCDQ00LT1 54 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 LEMD1Q68G75 181 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 LILRB2Q8N423 598 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC22AQ96IW7 307 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 HRH4Q9H3N8 390 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 RYR1P21817 5038 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 AGRNO00468 2067 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV1-39P01597 117 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV1D-39P04432 117 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 STHQ8IWL8 128 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4A16Q8NH70 328 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 S100GP29377 79 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 HRH1P35367 487 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 NPBWR1P48145 328 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R20P59543 309 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GU03 582 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 SPP1P10451 314 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 MIFP14174 115 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 HLA-DMAP28067 261 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 HLA-DMBP28068 263 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZTC4 211 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 RABAC1Q9UI14 185 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 K7EQG2 157 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM50AO95807 157 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 C4BPBP20851 252 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 NPPCP23582 126 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS3P35030 304 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 TGFBR1P36897 503 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 UCP3P55916 312 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN5P62079 268 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 NEDD8Q15843 81 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 SPINK9Q5DT21 86 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 Q9H521 79 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 X6R8D5 127 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PS18 150 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms