RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GNB1P62873 340 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLGLAQ15195 96 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NPBQ8NG41 125 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC35E1Q96K37 410 aa21.15■□□□□ 0.98
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A1W2PPV4 95 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VWC2LB2RUY7 222 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NBR2O15453 112 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PAX6P26367 422 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UBE2E1P51965 193 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRR20EP86478 221 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRR20CP86479 221 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRR20DP86480 221 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRR20BP86481 221 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRR20AP86496 221 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DYNAPQ8N1N2 210 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VAX2Q9UIW0 290 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC45A2Q9UMX9 530 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 REG1AP05451 166 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBP1P09467 338 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PVRIGQ6DKI7 326 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLEC2AQ6UVW9 174 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLXNB1O43157 2135 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NDUFA3O95167 84 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM249Q2WGJ8 235 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR2T10Q8NGZ9 312 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TEX22C9J3V5 150 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FCN1O00602 326 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AREGP15514 252 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TACC2O95359 2948 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NAV3Q8IVL0 2385 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LINC00869P0C866 280 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COX6B1P14854 86 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HES1Q14469 280 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR2T6Q8NHC8 308 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C17orf50Q8WW18 174 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MANBALQ9NQG1 85 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CD24P25063 80 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR10J1P30954 320 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC35E3Q7Z769 313 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LPAR2Q9HBW0 351 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WNK2Q9Y3S1 2297 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CEBPGP53567 150 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSMB3P49720 205 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EBI3Q14213 229 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AWAT1Q58HT5 328 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM88Q6PEY1 159 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR1P1Q8NH06 330 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MALSU1Q96EH3 234 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ACY3Q96HD9 319 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MED13LQ71F56 2210 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 APELAP0DMC3 54 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBLN7Q53RD9 439 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IQCF2Q8IXL9 164 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 M0R036 132 aa21.08■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STAG3L2P0CL84 134 aa21.08■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STAG3L3P0CL85 134 aa21.08■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MFAP2P55001 183 aa21.08■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RHOBP62745 196 aa21.08■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ETFRF1Q6IPR1 90 aa21.08■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q8N6K4 173 aa21.08■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNIH1O95406 144 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PAX8Q06710 450 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C5orf64Q2M2E5 130 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CBLN2Q8IUK8 224 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ABHD5Q8WTS1 349 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PERPQ96FX8 193 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AJUBAQ96IF1 538 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TSPAN4O14817 238 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PAX1P15863 534 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UNC79Q9P2D8 2635 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 H3BQ15 152 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CORTO00230 105 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CRYGCP07315 174 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CD81P60033 236 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM90A2PQ658T7 463 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GATAD1Q8WUU5 269 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MISP3Q96FF7 219 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CXorf1O96002 111 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SAA4P35542 130 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms