RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OR11H2Q8NH07 326 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 CDKN1AP38936 164 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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