RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF709Q8N972 641 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 LFNGQ8NES3 379 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PLXNB1O43157 2135 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CYB5BO43169 146 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TSPAN9O75954 239 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 AMY1AP04745 511 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CRYGCP07315 174 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TREML4Q6UXN2 200 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ABCA1O95477 2261 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 MPDU1O75352 247 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PRH1P02810 166 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 NMBP08949 121 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FAM157CP0CG43 387 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 GAMTQ14353 236 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFA5Q16718 116 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TEPPQ6URK8 271 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 OR5T1Q8NG75 326 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ACY3Q96HD9 319 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ITPR3Q14573 2671 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01548A6NM66 108 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 UMAD1C9J7I0 102 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 CAMLGP49069 296 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 RAB5CP51148 216 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 RAB31Q13636 194 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM68Q96MH6 324 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 MT-CO2P00403 227 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-48P01763 117 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 BLOC1S1P78537 153 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 SERF2P84101 59 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 CXorf58Q96LI9 332 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 MGST2Q99735 147 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 CREBBPQ92793 2442 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 G3V318 75 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 TRIM77I1YAP6 450 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 AGPAT2O15120 278 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 RND2P52198 227 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 BLCAPP62952 87 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 ACSM6Q6P461 480 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZRG5 221 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 NPIPB3Q92617 1050 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 SMR3AQ99954 134 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM160Q9NX00 188 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 LY6G6DO95868 133 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 IGHG2P01859 326 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 OR10J1P30954 320 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF616Q08AN1 781 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 VSIRQ9H7M9 311 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 THYN1Q9P016 225 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRR-209ENST00000549308 ITPR2Q14571 2701 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms