RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TRDCB7Z8K6 153 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 GABARAPH6UMI1 98 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 XRCC3O43542 346 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ATG12O94817 140 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CFDP00746 253 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 APOC3P02656 99 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CELP19835 753 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CXCL3P19876 107 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TCTAP57738 103 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF345Q14585 488 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 SFXN4Q6P4A7 337 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 MMD2Q8IY49 270 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 SAMD12Q8N8I0 201 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 LPAR5Q9H1C0 372 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 OR51M1Q9H341 326 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 MGAT4CQ9UBM8 478 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GVY2 172 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00473A8K010 186 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM14DPA8MWL7 114 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 RAB4BP61018 213 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 IGSF11Q5DX21 431 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 DNLZQ5SXM8 178 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM203Q969S6 136 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 RARRES2Q99969 163 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 MAP6D1Q9H9H5 199 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 PKD1P98161 4303 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 IGLL5B9A064 214 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 FABP1P07148 127 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 C8orf88P0DMB2 117 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 DUTP33316 252 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 QRFPP83859 136 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 OR2F1Q13607 317 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 INSL4Q14641 139 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 OR4A4PQ8NGN8 299 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 OR5B3Q8NH48 314 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 OR1S1Q8NH92 325 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 COQ8AQ8NI60 647 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 GALNT14Q96FL9 552 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 C5orf66Q9H5L9 145 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 HSF4Q9ULV5 492 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM218A2RU14 115 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TEX22C9J3V5 150 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 S1PR2O95136 353 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 BPNT1O95861 308 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CLEC3BP05452 202 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 RAB3BP20337 219 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM50BP56557 158 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 LRRTM1Q86UE6 522 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 GINS4Q9BRT9 223 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ARL6Q9H0F7 186 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 APLNQ9ULZ1 77 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 DISC1C4P0D8 188 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 G3V3Q6 166 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CXCL2P19875 107 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 RPL35P42766 123 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM91Q6ZNR0 172 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 BEST4Q8NFU0 473 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 FCAMRQ8WWV6 532 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 PECRQ9BY49 303 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 E7EUB6 86 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 DEFB4AO15263 64 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 FCGR3BO75015 233 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 NDUFB6O95139 128 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms