RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF524Q96C55 264 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PRE2 83 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 IGLV3-1P01715 115 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 CD55P08174 381 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 C3orf79P0CE67 100 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 GLRXP35754 106 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 KIR3DS1Q14943 382 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 OR9G1Q8NH87 305 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 ATP5J2P56134 94 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 OR4A5Q8NH83 315 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 MST1LQ2TV78 715 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PNR3 127 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 GAGE7O76087 117 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 GAGE12GP0CL81 117 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 GAGE12IP0CL82 117 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 GAGE4Q13068 117 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 IGLC3P0DOY3 106 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM160Q9NX00 188 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 PDLIM4P50479 330 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 NABP1Q96AH0 204 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 PRELID3AQ96N28 172 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0U1RQV1 116 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 C9orf172C9J069 976 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 K7EP34 96 aa5.09□□□□□ -1.6
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