RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.77□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 IL7P13232 177 aa8.76□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 MFAP2P55001 183 aa8.76□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM187Q14656 261 aa8.76□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.76□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 LGI3Q8N145 548 aa8.76□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.76□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 TGOLN2O43493 480 aa8.75□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 P0C879 139 aa8.75□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.75□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.75□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 GALNT14Q96FL9 552 aa8.75□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0B4J2A0 478 aa8.74□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 CSN3P07498 182 aa8.74□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 GP9P14770 177 aa8.74□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SPCS3P61009 180 aa8.74□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 Q6ZRM9 215 aa8.74□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.74□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.74□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.74□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.73□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 YIF1AO95070 293 aa8.73□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV1-51P01701 117 aa8.73□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 OPRK1P41145 380 aa8.73□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 C4orf46Q504U0 113 aa8.73□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 C2orf70A6NJV1 201 aa8.72□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 LYRM1O43325 122 aa8.72□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 FOLR2P14207 255 aa8.72□□□□□ -1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 KLK9Q2XQG4 91 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 TM4SF20Q53R12 229 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 GPHB5Q86YW7 130 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.72□□□□□ -1.01
UBASH3B-208ENST00000533451 I3L2K1 104 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 LGALS9O00182 355 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 CORTO00230 105 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 IFNA10P01566 189 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 HTR2BP41595 481 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 NMSQ5H8A3 153 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 OR52E5Q8NH55 327 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC32Q9BV29 185 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-208ENST00000533451 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.71□□□□□ -1.02
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