RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528768.5

USF1-208, Transcript of upstream transcription factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene USF1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1-208ENST00000528768 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.53□□□□□ -0.88
USF1-208ENST00000528768 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.53□□□□□ -0.88
USF1-208ENST00000528768 CADP27708 2225 aa9.53□□□□□ -0.88
USF1-208ENST00000528768 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.52□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 PRSS46E5RG02 174 aa9.52□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 PDE6DO43924 150 aa9.52□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 CXorf1O96002 111 aa9.52□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 IGKV1D-33P01593 117 aa9.52□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 IGKV1-33P01594 117 aa9.52□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 HNF1AP20823 631 aa9.52□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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USF1-208ENST00000528768 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.51□□□□□ -0.89
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USF1-208ENST00000528768 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.5□□□□□ -0.89
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USF1-208ENST00000528768 YIF1AO95070 293 aa9.48□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 CDKN1AP38936 164 aa9.48□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 REG1BP48304 166 aa9.48□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 ADIRFQ15847 76 aa9.48□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 BSXQ3C1V8 233 aa9.48□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USF1-208ENST00000528768 CST9LP1Q5W188 147 aa9.48□□□□□ -0.89
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