RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 STAG3L2P0CL84 134 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TAS2R60P59551 318 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 NEU1Q99519 415 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 NMUP48645 174 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6AWC8 147 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 RNF5Q99942 180 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 B4DSR2 109 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PAX1P15863 534 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 OR1P1Q8NH06 330 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087WV48 116 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 SRIP30626 198 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM166AQ6J272 317 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 OR4C46A6NHA9 309 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 ID3Q02535 119 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PLXNA3P51805 1871 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PKIAP61925 76 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 RHOGP84095 191 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 LRTM2Q8N967 370 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0A6YYD4 124 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0B4J293 547 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 COPS9Q8WXC6 57 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1B0GW15 77 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM42Q69YG0 159 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 MARVELD3Q96A59 401 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 RNF125Q96EQ8 232 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 OTORQ9NRC9 128 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 RNF222A6NCQ9 220 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 MPTX1A8MV57 137 aa14.48□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 NPFFO15130 113 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 GFI1Q99684 422 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 EGR1P18146 543 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 FREM3P0C091 2139 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 C9JCJ5 164 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.47□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 FOLR2P14207 255 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 MGAMO43451 1857 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 RAMP3O60896 148 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TFF1P04155 84 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF383Q8NA42 475 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 Q9H3A6 140 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 M0R1W7 72 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 DUX3Q96PT4 197 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.46□□□□□ -0.09
PTDSS1-202ENST00000517309 CBY3A6NI87 242 aa14.46□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 BTCP35070 178 aa14.46□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 ROS1P08922 2347 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1B0GUT8 65 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 CIDEAO60543 219 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 COX6CP09669 75 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 IL36BQ9NZH7 164 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 MED12Q93074 2177 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 NAPSAO96009 420 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC25A16P16260 332 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 RAB37Q96AX2 223 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 KCNS1Q96KK3 526 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 ASCL2Q99929 193 aa14.45□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 LDLRAD4O15165 306 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 PSPNO60542 156 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 CD24P25063 80 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 ERASQ7Z444 233 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 M0R381 172 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 NBASA2RRP1 2371 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1W2PRX2 142 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms