RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 Q6ZS92 163 aa7.27□□□□□ -1.24
GPBP1-208ENST00000514387 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
GPBP1-208ENST00000514387 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.27□□□□□ -1.24
GPBP1-208ENST00000514387 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.27□□□□□ -1.24
GPBP1-208ENST00000514387 H0Y8X5 98 aa7.27□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 LEPROTL1O95214 131 aa7.27□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SRD5A1P18405 259 aa7.27□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 TCTAP57738 103 aa7.27□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PLP2Q04941 152 aa7.27□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.27□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.27□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.27□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.26□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.26□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 ZNF32P17041 273 aa7.26□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.26□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.26□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.26□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 CT45A6P0DMU7 189 aa7.25□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 CT45A5P0DMU8 189 aa7.25□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 CT45A7P0DMV0 189 aa7.25□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 TEPPQ6URK8 271 aa7.24□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.24□□□□□ -1.25
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GPBP1-208ENST00000514387 G6PCP35575 357 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 MFAP2P55001 183 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 Q6Q795 121 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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