RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 ERHP84090 104 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
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ITGA3-211ENST00000508100 FAM90A2PQ658T7 463 aa12□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 C2CD4CQ8TF44 421 aa12□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 FXYD6Q9H0Q3 95 aa12□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 ANAPC10Q9UM13 185 aa12□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 ST8SIA3O43173 380 aa11.99□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 NAT1P18440 290 aa11.99□□□□□ -0.49
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ITGA3-211ENST00000508100 PRCDQ00LT1 54 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 LEMD1Q68G75 181 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 TOMM20LQ6UXN7 152 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 ST8SIA2Q92186 375 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 SEC22AQ96IW7 307 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.96□□□□□ -0.49
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ITGA3-211ENST00000508100 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.96□□□□□ -0.49
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ITGA3-211ENST00000508100 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 VSIRQ9H7M9 311 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 RABAC1Q9UI14 185 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 IGLL5B9A064 214 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 C11orf94C9JXX5 98 aa11.95□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 GPR141Q7Z602 305 aa11.95□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 A0A1W2PS18 150 aa11.94□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 SLC35G3Q8N808 338 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV1-39P01597 117 aa11.93□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 NPPCP23582 126 aa11.93□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 UCP3P55916 312 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 GPX8Q8TED1 209 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 HRH4Q9H3N8 390 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 KMT2AQ03164 3969 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 SCGB2A1O75556 95 aa11.92□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 IFNA17P01571 189 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.92□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 SCPEP1Q9HB40 452 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 APLNQ9ULZ1 77 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1B0GU03 582 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 CORTO00230 105 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 ATG12O94817 140 aa11.91□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 AKR1C2P52895 323 aa11.91□□□□□ -0.5
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ITGA3-211ENST00000508100 CTF1Q16619 201 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 GPR107Q5VW38 600 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 Q8NAQ8 132 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.91□□□□□ -0.5
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