RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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SEC22C-216ENST00000493107 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 VSIRQ9H7M9 311 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 PARP11Q9NR21 331 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.37□□□□□ -1.23
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SEC22C-216ENST00000493107 NDUFB8O95169 186 aa7.36□□□□□ -1.23
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SEC22C-216ENST00000493107 LINC00869P0C866 280 aa7.36□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
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SEC22C-216ENST00000493107 NPIPB3Q92617 1050 aa7.36□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM68Q96MH6 324 aa7.36□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.36□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF702PQ9H963 129 aa7.36□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF580Q9UK33 172 aa7.36□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.36□□□□□ -1.23
SEC22C-216ENST00000493107 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.36□□□□□ -1.23
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