RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZS49 121 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T4Q8NH00 348 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 DCUN1D1Q96GG9 259 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRSQ13332 1948 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0J9YY10 115 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GX78 115 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TFPTP0C1Z6 253 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 CCL5P13501 91 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TPRXLQ17RH7 258 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 NAT8Q9UHE5 227 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 UGGT2Q9NYU1 1516 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3C2AO00443 1686 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 PLCH1Q4KWH8 1693 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 VCANP13611 3396 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 UBR1Q8IWV7 1749 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 J3QKU1 62 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 OR8B12Q8NGG6 310 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 VCX3BQ9H321 246 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 IL36BQ9NZH7 164 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB4P16144 1822 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 FADDQ13158 208 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB115Q30KQ5 88 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM42Q69YG0 159 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB123Q8N688 67 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf76Q96K31 380 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 CHST6Q9GZX3 395 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM22Q9Y584 194 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 NWD2Q9ULI1 1742 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM114B3SHH9 223 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DRB1P01911 266 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-212ENST00000491302 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-212ENST00000491302 CCL20P78556 96 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-212ENST00000491302 C8orf4Q9NR00 106 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 CMTM6Q9NX76 183 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 SLIT1O75093 1534 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 FLT4P35916 1363 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PKD1L3Q7Z443 1732 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GVG6 124 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 IRGMA1A4Y4 181 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 GGT3PA6NGU5 568 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PRM2P04554 102 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA7P05543 415 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DMBP28068 263 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PCOTHQ58A44 107 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 KLK6Q92876 244 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 ULBP3Q9BZM4 244 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 CISHQ9NSE2 258 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1BQ00975 2339 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HMSDA8MTL9 139 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-8O75690 187 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-7P01780 117 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP12-1P59990 96 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 RANP62826 216 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 STX5Q13190 355 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC37A3O60309 1634 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN23Q9H3S7 1636 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.11□□□□□ -1.91
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