RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486862.1

OPTN-211, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 423 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-211ENST00000486862 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 BTNL8Q6UX41 500 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 ZNF580Q9UK33 172 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.54□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 LINC00862A6NCI5 91 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 TRIM77I1YAP6 450 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 FGF7P21781 194 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 GAMTQ14353 236 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 TMEM86BQ8N661 226 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 SLC35E1Q96K37 410 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 RSG1Q9BU20 258 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 MED9Q9NWA0 146 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 AKAP9Q99996 3911 aa8.52□□□□□ -1.04
OPTN-211ENST00000486862 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 BTBD17A6NE02 478 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 I3L2K1 104 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ATP6V0E1O15342 81 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 BRI3O95415 125 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 IGF1P05019 195 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 APELAP0DMC3 54 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 OPRK1P41145 380 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 BLOC1S1P78537 153 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 MLANAQ16655 118 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TEPPQ6URK8 271 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 THAP8Q8NA92 274 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 LFNGQ8NES3 379 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 MGST2Q99735 147 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PARP11Q9NR21 331 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 RFNGQ9Y644 331 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ITPR3Q14573 2671 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ITPR2Q14571 2701 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SMCO3A2RU48 225 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 LINC01548A6NM66 108 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CYB5BO43169 146 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 MT-CO2P00403 227 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 FOSL1P15407 271 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 HNF1AP20823 631 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CAMLGP49069 296 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 AKR1C1Q04828 323 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 RAB31Q13636 194 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ZNF709Q8N972 641 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 K7EIM0 57 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 AGPAT2O15120 278 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 MBP02144 154 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 DEFA4P12838 97 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 BLCAPP62952 87 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PRR20EP86478 221 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PRR20CP86479 221 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PRR20DP86480 221 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PRR20BP86481 221 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PRR20AP86496 221 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SCGB2A2Q13296 93 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ACSM6Q6P461 480 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.5□□□□□ -1.05
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