RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486700.1

GPR17-204, Transcript of G protein-coupled receptor 17, human

TSL 1 (best)

Gene GPR17, Length 2,175 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPR17-204	ENST00000486700	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	FAM168A	Q92567	244 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	TECTA	O75443	2155 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	SIAH2	O43255	324 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	RTL8B	Q17RB0	113 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	LYG1	Q8N1E2	194 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	UPK2	O00526	184 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	LHB	P01229	141 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	C8orf88	P0DMB2	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	C2orf83	Q53S99	150 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700		Q6ZN92	141 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	OR9G1	Q8NH87	305 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	OR2V2	Q96R30	315 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GPR17-204	ENST00000486700	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	MORN5	Q5VZ52	161 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	TXN2	Q99757	166 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	PSMB11	A5LHX3	300 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	SELENOV	P59797	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	MBD6	Q96DN6	1003 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	LINC00479	Q96M42	142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	LNP1	A1A4G5	178 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	IGKV1-16	P04430	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	NTF3	P20783	257 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	FAM201A	Q5SY85	155 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	BORCS7	Q96B45	105 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	CT45A6	P0DMU7	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	CT45A5	P0DMU8	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	CT45A7	P0DMV0	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	MAJIN	Q3KP22	176 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	RASL11A	Q6T310	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	TCF21	O43680	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	CD69	Q07108	199 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ATOH7	Q8N100	152 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	RAB9B	Q9NP90	201 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	CAD	P27708	2225 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	GNG10	P50151	68 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	TNXA	Q16473	311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	LCN12	Q6JVE5	192 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	TSPO	P30536	169 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	STUM	Q69YW2	141 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	CD59	P13987	128 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	PMCHL1	Q16048	86 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	NUP35	Q8NFH5	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	FAM222B	Q8WU58	562 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPR17-204	ENST00000486700	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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