RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 OR5B21A6NL26 309 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 CX3CL1P78423 397 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A34Q6PIV7 304 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 CSTL1Q9H114 145 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 C21orf140B9A014 251 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00869P0C866 280 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 DCTN5Q9BTE1 182 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 WNT9BO14905 357 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 HBZP02008 142 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 OR9G9P0C7N8 305 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 PSG9Q00887 426 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 EFNB3Q15768 340 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00470Q9BZP3 86 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 RPL24P83731 157 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 FAM168AQ92567 244 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 PMS2P5A8MQ11 134 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 ESDP10768 282 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A40Q8TBP6 338 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 ACACAQ13085 2346 aa13.39□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 C12orf77C9JDV5 145 aa13.39□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GPR12P47775 334 aa13.39□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB124Q8NES8 71 aa13.39□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 NEUROG1Q92886 237 aa13.39□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D28Q2M2D7 210 aa13.39□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00473A8K010 186 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 IGFBP2P18065 325 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 WDR86Q86TI4 376 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SCCPDHQ8NBX0 429 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GNG7O60262 68 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF138P52744 262 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TEPPQ6URK8 271 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV3A0A0B4J244 114 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MOB1BQ7L9L4 216 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 FDCSPQ8NFU4 85 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TAAR6Q96RI8 345 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 NBASA2RRP1 2371 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 OPRK1P41145 380 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PNKDQ8N490 385 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TAX1BP3O14907 124 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 LEPROTL1O95214 131 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MPV17P39210 176 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MUC15Q8N387 334 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SARAFQ96BY9 339 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SAP30LQ9HAJ7 183 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PSPNO60542 156 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-48P01763 117 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC10Q5BKY1 277 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 VWA1Q6PCB0 445 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MOB3BQ86TA1 216 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MDS2Q8NDY4 140 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PKDREJQ9NTG1 2253 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 J3QT63 122 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-2P23083 117 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 C12orf54Q6X4T0 127 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM12Q96EX1 92 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RTL8AQ9BWD3 113 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 CORTO00230 105 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 HAND1O96004 215 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PLAUP00749 431 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 HOXC12P31275 282 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM116Q8NCL8 245 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF883P0CG24 379 aa13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MYOD1P15172 320 aa13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 LEAP2Q969E1 77 aa13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MPC1Q9Y5U8 109 aa13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PLCE1Q9P212 2302 aa13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF497Q6ZNH5 498 aa13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 OR4F17Q8NGA8 305 aa13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 C7orf71A4D174 169 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PPBPP02775 128 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM178AQ8NBL3 297 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF19Q9NS68 423 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP13Q9UII6 198 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SPTA1P02549 2419 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 AHRRA9YTQ3 701 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96 ms