RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA1O95477 2261 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SPG11Q96JI7 2443 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PN81 502 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPH5 198 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SMCO3A2RU48 225 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 VWC2LB2RUY7 222 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN4O14817 238 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A17O43808 307 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 OR5G3P0C626 314 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RNF224P0DH78 156 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CNTFRP26992 372 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CHRNA7P36544 502 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PSMB3P49720 205 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RND2P52198 227 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PRRX1P54821 245 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 EBI3Q14213 229 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 KLK9Q2XQG4 91 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RNF212Q495C1 297 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 STPG3Q8N7X2 389 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 NPBQ8NG41 125 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf50Q8WW18 174 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF503Q96F45 646 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TIMD4Q96H15 378 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 KCNIP2Q9NS61 270 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN13Q12923 2485 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPE2 198 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP92A6NM28 416 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 OOSP1A8MZH6 123 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 B4DEV8 164 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PHOX2AO14813 284 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CYB5BO43169 146 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 IFNA4P05014 189 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CRYBA1P05813 215 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G2AP14555 144 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CDKN1AP38936 164 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 AKR1C3P42330 323 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 HNF4GQ14541 408 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MLANAQ16655 118 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 SPNS3Q6ZMD2 512 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF709Q8N972 641 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf52Q96A22 123 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TVP23CQ96ET8 276 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35E1Q96K37 410 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TBX15Q96SF7 602 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MDFIQ99750 246 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 COMMD5Q9GZQ3 224 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ENY2Q9NPA8 101 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 DPM3Q9P2X0 92 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TENM4Q6N022 2769 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 POLQO75417 2590 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PR64 198 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PRV1 198 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf65A6NEN9 183 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 FCN1O00602 326 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TIMM23O14925 209 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ENSAO43768 121 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PAGE4O60829 102 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV4-39P01824 125 aa4.49□□□□□ -1.69
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