RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	LGALS9	O00182	355 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV12-3	P01733	135 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	ARL3	P36405	182 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	HTR2B	P41595	481 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	NOXA1	Q86UR1	476 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPA-222	ENST00000445241	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241		K7EIM0	57 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	PITX3	O75364	302 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	LY86	O95711	162 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241		I3L2K1	104 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC3B	P05452	202 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241		A8MWP6	167 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	TGOLN2	O43493	480 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	SAP30	O75446	220 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	MED6	O75586	246 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	IFNA21	P01568	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	MFAP4	P55083	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf83	Q53S99	150 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	PLET1	Q6UQ28	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	MITD1	Q8WV92	249 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	MISP3	Q96FF7	219 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	NUDT15	Q9NV35	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241		U3KQ87	197 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	MT-CO2	P00403	227 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	GPR183	P32249	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	DEFA1	P59665	94 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	DEFA3	P59666	94 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	DTD1	Q8TEA8	209 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	PALMD	Q9NP74	551 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	NPBWR1	P48145	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	ENKUR	Q8TC29	256 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241		S4R3C0	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA4	O00483	81 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	OR2C1	O95371	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	CSN3	P07498	182 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	HOXB5	P09067	269 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	NPY1R	P25929	384 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241		Q56UQ5	140 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	RBKS	Q9H477	322 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPA-222	ENST00000445241	IL5	P05113	134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPA-222	ENST00000445241	CTSG	P08311	255 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A4	P12235	298 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPA-222	ENST00000445241	OPRK1	P41145	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPA-222	ENST00000445241	IFITM3	Q01628	133 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPA-222	ENST00000445241	OR4X1	Q8NH49	305 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPA-222	ENST00000445241	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63

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