RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 OR10C1Q96KK4 312 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 COPZ2Q9P299 210 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 EXTL2Q9UBQ6 330 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SACSQ9NZJ4 4579 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 GABARAPO95166 117 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IFNA17P01571 189 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CD3DP04234 171 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 PAFAH1B2P68402 229 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 OR52I2Q8NH67 350 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RNF2Q99496 336 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CORTO00230 105 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CHEK1O14757 476 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 B3GALNT1O75752 331 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 PI3P19957 117 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TAS2R19P59542 299 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CTF1Q16619 201 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TRIM16LQ309B1 348 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 DEFB135Q30KP9 77 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TERB2Q8NHR7 220 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 ENY2Q9NPA8 101 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CXorf65A6NEN9 183 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SCGB2A1O75556 95 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 PPP5CP53041 499 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TNFRSF9Q07011 255 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 GPR107Q5VW38 600 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 LYG2Q86SG7 212 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TP53RKQ96S44 253 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 LYSTQ99698 3801 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 A0A0B4J293 547 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 A0A0J9YWU9 116 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 NUPR2A6NF83 97 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RGS5O15539 181 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RAB3DO95716 219 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IGKV1-5P01602 117 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-48P01763 117 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TFPI2P48307 235 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SPINK9Q5DT21 86 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 RNF183Q96D59 192 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 ABHD1Q96SE0 405 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 GABARAPH6UMI1 98 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 ST8SIA3O43173 380 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CD74P04233 296 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 MEF2DQ14814 521 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TOMM20LQ6UXN7 152 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 FAM219AQ8IW50 185 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 P0C879 139 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 UCP1P25874 307 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 ETV6P41212 452 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 PMS2P11Q13670 270 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 SP6Q3SY56 376 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TCF24Q7RTU0 167 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 GPR141Q7Z602 305 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 CSTL1Q9H114 145 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
HERC3-206ENST00000431413 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 A0A1W2PS18 150 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 MPTX1A8MV57 137 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 DISC1C4P0D8 188 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 TMEM50AO95807 157 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 SMIM18P0DKX4 95 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 OPRK1P41145 380 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 FAM90A2PQ658T7 463 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 GBGT1Q8N5D6 347 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-206ENST00000431413 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms