RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C8orf46Q8TAG6 207 aa15.08■□□□□ 0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB1BQ9H0U4 201 aa15.08■□□□□ 0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NIT2Q9NQR4 276 aa15.08■□□□□ 0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUT9Q9Y231 359 aa15.08■□□□□ 0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LY6HO94772 140 aa15.08■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MT-CO2P00403 227 aa15.08■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PFN1P07737 140 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC01551Q86U37 167 aa15.08■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.08■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8B3Q8NGG8 313 aa15.08■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8B2Q96RD0 313 aa15.08■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHOX2AO14813 284 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QTNF9P0C862 333 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2T6Q8NHC8 308 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIOXQ9UGB7 285 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCO2A0A1W2PP80 73 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PPI3 338 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NECAP1Q8NC96 275 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACY3Q96HD9 319 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.07■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FABP1P07148 127 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRGC1P0CF51 173 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX7A1P24310 79 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALR1P47211 349 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNKDQ8N490 385 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX45Q8NA69 505 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRZBQ92765 325 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYGO2Q9BRQ0 406 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INSIG2Q9Y5U4 225 aa15.06■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LY6DQ14210 128 aa15.05■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5T1Q8NG75 326 aa15.05■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5B12Q96R08 314 aa15.05■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf24Q9BVV8 132 aa15.05■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELOVL1Q9BW60 279 aa15.05■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51M1Q9H341 326 aa15.05■□□□□ 0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa15.05■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5G3P0C626 314 aa15.05■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S100PP25815 95 aa15.05■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTFRP26992 372 aa15.05■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15.05■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C22orf46C9J442 243 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIPFP07098 398 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRYGBP07316 175 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOD3P08294 240 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS8Q16651 343 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMD2Q8IY49 270 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF114Q8NC26 417 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ONECUT1Q9UBC0 465 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLC7A0M8Q6 106 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGPEP1LA6NFU8 196 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REG1AP05451 166 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSG5Q15238 335 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF503Q96F45 646 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMD4Q96H15 378 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.04■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLXNB1O43157 2135 aa15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD99P14209 185 aa15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIST3H2BBQ8N257 126 aa15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM37Q8WXS4 190 aa15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf52Q96A22 123 aa15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPEQ96AT9 228 aa15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM167BQ9NRX6 74 aa15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.02■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMB11A5LHX3 300 aa15.02■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R2P9O14990 202 aa15.02■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S100A2P29034 98 aa15.02■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNXAQ16473 311 aa15.02■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.02■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIGLEC9Q9Y336 463 aa15.02■□□□□ -0
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AREGP15514 252 aa15.02□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R45P59539 299 aa15.02□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPIPB3Q92617 1050 aa15.02□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UHRF2Q96PU4 802 aa15.02□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00587B1AMM8 73 aa15.01□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LY6LH3BQJ8 138 aa15.01□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR7C2O60412 319 aa15.01□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV3-48P01763 117 aa15.01□□□□□ -0.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRP14P37108 136 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms