RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CD24P25063 80 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRNA7P36544 502 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMB3P49720 205 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 GNB1P62873 340 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LCN2P80188 198 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PLGLAQ15195 96 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PSG5Q15238 335 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 HCP5Q6MZN7 132 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MMD2Q8IY49 270 aa3.2□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 ISOC2Q96AB3 205 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ACY3Q96HD9 319 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXL15Q9H469 300 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 DPM3Q9P2X0 92 aa3.2□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 PRTN3P24158 256 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2G2P60604 165 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CD69Q07108 199 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 GAMTQ14353 236 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 Q5PR19 223 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 STPG3Q8N7X2 389 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX45Q8NA69 505 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 LY6LH3BQJ8 138 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R1W7 72 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 FCN1O00602 326 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX15O60248 233 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10J1P30954 320 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 PCP4P48539 62 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CD81P60033 236 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 HES1Q14469 280 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SSX2Q16385 188 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 TVP23CQ96ET8 276 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35E1Q96K37 410 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4F4Q96R69 305 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 P2RX4Q99571 388 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 USP24Q9UPU5 2620 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV2-5P01817 119 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF224P0DH78 156 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CEACAM3P40198 252 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC2AQ6UVW9 174 aa3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.19□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 COLCA2A8K830 154 aa3.18□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 FNDC10F2Z333 226 aa3.18□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 J3KRW8 73 aa3.18□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OVOL3O00110 214 aa3.18□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 VENTXO95231 258 aa3.18□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CNIH1O95406 144 aa3.18□□□□□ -1.9
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