RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 DBX1A6NMT0 343 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 I3L2K1 104 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 K7EIM0 57 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ST8SIA3O43173 380 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-23P01764 117 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CD5P06127 495 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 HTR2BP41595 481 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 MFAP2P55001 183 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 Q56UQ5 140 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TUBA4BQ9H853 241 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMAT4Q9H898 229 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 S4R3C0 116 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 V9GYH0 126 aa6.44□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0B4J2A0 478 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM213A2RRL7 107 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2T8A6NH00 312 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 C15orf62A8K5M9 175 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF785A8K8V0 405 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 GNG7O60262 68 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 MT-CO2P00403 227 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CTSGP08311 255 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 AKR1C4P17516 323 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 BMI1P35226 326 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 INPP1P49441 399 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CCR6P51684 374 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM187Q14656 261 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 LGI3Q8N145 548 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM63Q969Q1 353 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 MISP3Q96FF7 219 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.43□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CENPXA8MT69 81 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ADMP35318 185 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF79Q15937 498 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 GUCA2BQ16661 112 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TM4SF20Q53R12 229 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR146Q96CH1 333 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 NEURL2Q9BR09 285 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 GINS3Q9BRX5 216 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CACNG5Q9UF02 275 aa6.42□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1B0GU03 582 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 F8W735 103 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A4P12235 298 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A6P12236 298 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 CD81P60033 236 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SMCO1Q147U7 214 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 BSXQ3C1V8 233 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 C2orf83Q53S99 150 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIQKQ629K1 86 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZRM9 215 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 LRTM2Q8N967 370 aa6.41□□□□□ -1.38
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.41□□□□□ -1.38
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