RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 OR8I2Q8N0Y5 310 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SMRP1Q8NCR6 262 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR2T11Q8NH01 316 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR51F2Q8NH61 342 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CT45A3Q8NHU0 189 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FNDC9Q8TBE3 224 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 Q8WTZ3 238 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PTX4Q96A99 478 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TIMD4Q96H15 378 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC30Q96LL9 226 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf48Q96LS8 159 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 RASL11BQ9BPW5 248 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SMCO4Q9NRQ5 59 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DMAC2Q9NW81 257 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ERG28Q9UKR5 140 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 GPR179Q6PRD1 2367 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LRP2P98164 4655 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C2CD3Q4AC94 2353 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MCRIP1C9JLW8 97 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C17orf112F2Z3M2 114 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MPDU1O75352 247 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TCRBP04435 133 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MEOX2P50222 304 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 IL15RAQ13261 267 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ORMDL2Q53FV1 153 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CST9Q5W186 159 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FAM71E1Q6IPT2 247 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 GKN2Q86XP6 184 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C5orf17Q8NAS9 161 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SLC30A7Q8NEW0 376 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR13C8Q8NGS7 320 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR2T6Q8NHC8 308 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR51E1Q8TCB6 317 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 GALMQ96C23 342 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 RNF5Q99942 180 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM191AQ9H0A3 160 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C20orf85Q9H1P6 137 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 NAA60Q9H7X0 242 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR5AC2Q9NZP5 309 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ABRACLQ9P1F3 81 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 COQ4Q9Y3A0 265 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TTC3P53804 2025 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 NCKAP5O14513 1909 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LINC01548A6NM66 108 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TAAR5O14804 337 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TAX1BP3O14907 124 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PSCAO43653 123 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF30P17039 623 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 BTG1P62324 171 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SPCS2Q15005 226 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF726P1Q15940 193 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf113Q5VZT2 155 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS54Q6PEW0 395 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TCF23Q7RTU1 214 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF441Q8N8Z8 693 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DCAF4L2Q8NA75 395 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS33Q8NF86 280 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR1J4Q8NGS1 313 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR5H6Q8NGV6 325 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LYPD6BQ8NI32 183 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ORAOV1Q8WV07 137 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A46Q96AG3 418 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ESM1Q9NQ30 184 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM38BQ9NVV0 291 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 RARRES3Q9UL19 164 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 HHLA2Q9UM44 414 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LY96Q9Y6Y9 160 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TACC2O95359 2948 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF462Q96JM2 2506 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WUU8 490 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 B4DEV8 164 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 INAFM1C9JVW0 142 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPB9F8W1W9 429 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 UPK1AO00322 258 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5LO75964 103 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFB2O95178 105 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR2H2O95918 312 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 UBBP0CG47 229 aa1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms