RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM213A2RRL7 107 aa20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 MT-CO2P00403 227 aa20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 VAMP1P23763 118 aa20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 ADMP35318 185 aa20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R1AQ13522 171 aa20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD55Q3KP44 614 aa20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM128Q5BJH2 165 aa20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 UBAC2Q8NBM4 344 aa20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TPGS1-201ENST00000359315 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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TPGS1-201ENST00000359315 A0A0B4J2A0 478 aa20.45■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF320A2RRD8 509 aa20.45■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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TPGS1-201ENST00000359315 NDUFB6O95139 128 aa20.44■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 FOLR2P14207 255 aa20.44■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 SPCS3P61009 180 aa20.44■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 Q56UQ5 140 aa20.44■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 PVRIGQ6DKI7 326 aa20.44■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.44■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 NAP1L6A6NFF2 107 aa20.43■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 A8MWP6 167 aa20.43■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 ANXA3P12429 323 aa20.43■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 SNCAP37840 140 aa20.43■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 TM4SF20Q53R12 229 aa20.43■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 OR52E5Q8NH55 327 aa20.43■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G10O15496 165 aa20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 SFT2D2O95562 160 aa20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 SULT1A3P0DMM9 295 aa20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 SULT1A4P0DMN0 295 aa20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 BSXQ3C1V8 233 aa20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 FAM106AQ4KMX7 169 aa20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 ENY2Q9NPA8 101 aa20.42■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 CBLN1P23435 193 aa20.41■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 SRPXP78539 464 aa20.41■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 DYNLRB2Q8TF09 96 aa20.41■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 TGP01266 2768 aa20.41■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 CTSGP08311 255 aa20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB114Q30KQ6 69 aa20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM190Q8WZ59 177 aa20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 B9D2Q9BPU9 175 aa20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-201ENST00000359315 CEBPZOSA8MTT3 80 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 MFAP4P55083 255 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 SMCO1Q147U7 214 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 MLANAQ16655 118 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 SPSB3Q6PJ21 355 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 Q8N1Y9 231 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 LRTM2Q8N967 370 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM170AQ8WVE7 144 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V0BQ99437 205 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 MLXQ9UH92 298 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 DNAH9Q9NYC9 4486 aa20.39■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 LCN12Q6JVE5 192 aa20.38■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.38■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa20.38■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 TNFRSF9Q07011 255 aa20.37■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 CD69Q07108 199 aa20.37■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 BTNL8Q6UX41 500 aa20.36■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 SLC24A4Q8NFF2 622 aa20.36■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 HSPB7Q9UBY9 170 aa20.36■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf170A2RU37 121 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF785A8K8V0 405 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 CENPXA8MT69 81 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFA4O00483 81 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 OR2K2Q8NGT1 345 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 TXN2Q99757 166 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 ASCL2Q99929 193 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 C20orf24Q9BUV8 137 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 RBKSQ9H477 322 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 UFC1Q9Y3C8 167 aa20.35■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1B0GU03 582 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 LYRM1O43325 122 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 PITX3O75364 302 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 C8orf88P0DMB2 117 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 OPRK1P41145 380 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 HTR2BP41595 481 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM61Q8N0U2 210 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 OR1S1Q8NH92 325 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC32Q9BV29 185 aa20.34■□□□□ 0.85
TPGS1-201ENST00000359315 PALMDQ9NP74 551 aa20.34■□□□□ 0.85
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