RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 PMCHL1Q16048 86 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 CFPP27918 469 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 GPR183P32249 361 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 DOCK9Q9BZ29 2069 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 C2orf83Q53S99 150 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 TUBA4BQ9H853 241 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 GPX1P07203 203 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 MAP1LC3AQ9H492 121 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 PROK2Q9HC23 129 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 NBASA2RRP1 2371 aa17.19■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 IGKV1-5P01602 117 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 ASCL4Q6XD76 172 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 TEX29Q8N6K0 151 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 CD24P25063 80 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 CD69Q07108 199 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 GCSAMLQ5JQS6 135 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP17.18■□□□□ 0.347e-6■■■■□ 19.5
NISCH-201ENST00000345716 COL6A6A6NMZ7 2263 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 IMMP2LQ96T52 175 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 HLA-DRB1P01911 266 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 FER1L5A0AVI2 2057 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 A1L4Q6 167 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 A6NDN8 102 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 OR4C46A6NHA9 309 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 THBDP07204 575 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 LY6DQ14210 128 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 Q6ZS92 163 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 SYT8Q8NBV8 401 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 MBD3L1Q8WWY6 194 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 AP5S1Q9NUS5 200 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 ZNF407Q9C0G0 2248 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 MLNRO43193 412 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 TCF24Q7RTU0 167 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 FOLR2P14207 255 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 TAS2R60P59551 318 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 Q9H3A6 140 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 CD5P06127 495 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 C7orf69Q9H7B7 122 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 A0A0G2JNJ9 132 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 DDTP30046 118 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 HEPN1Q6WQI6 88 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 COQ2Q96H96 371 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 Q9UFV3 132 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 DLX1P56177 255 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 OR10W1Q8NGF6 305 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 CBY1Q9Y3M2 126 aa17.15■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 EFNB3Q15768 340 aa17.14■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa17.14■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 Q6ZS49 121 aa17.14■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 ELOVL1Q9BW60 279 aa17.14■□□□□ 0.34
NISCH-201ENST00000345716 C1QTNF9P0C862 333 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 LYRM7Q5U5X0 104 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 OR10AG1Q8NH19 301 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 SNCGO76070 127 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 CLEC19AQ6UXS0 136 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 TREML4Q6UXN2 200 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 FMC1Q96HJ9 113 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 DMRTA2Q96SC8 542 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 TIMM23O14925 209 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 HS3ST6Q96QI5 342 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 TMEM200BQ69YZ2 307 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 C20orf204Q6ZNR8 217 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 AUP1Q9Y679 476 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 TMEM178BH3BS89 294 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 COLCA1Q6ZS62 124 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 IGKV3-15P01624 115 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 ZNF502Q8TBZ5 544 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 TNFRSF14Q92956 283 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 PKDREJQ9NTG1 2253 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 DDB2Q92466 427 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 NUDT3O95989 172 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 PYYP10082 97 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 C10orf55Q5SWW7 151 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 UQCR10Q9UDW1 63 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 DMRT1Q9Y5R6 373 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 HERPUD1Q15011 391 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 GPR82Q96P67 336 aa17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms