RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAT1Q6PIZ9 186 aa18.23■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CT45A3Q8NHU0 189 aa18.23■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM181BA6NEQ2 426 aa18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSBP1O75506 76 aa18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPRNQ5BIV9 151 aa18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 M0R2Z0 102 aa18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR2Z1Q8NG97 314 aa18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 BET1LQ9NYM9 111 aa18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 LOC105371242A0A075B767 164 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 LPAL2Q16609 132 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPRY4Q9C004 299 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPR179Q6PRD1 2367 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR4F17Q8NGA8 305 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.21■□□□□ 0.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 J3QR06 171 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF738Q8NE65 137 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CER1O95813 267 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAMPP49913 170 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRR27Q6MZM9 219 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP35Q8NFH5 326 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CORO2AQ92828 525 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALYQ9NYX4 217 aa18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TOMM40O96008 361 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM201AQ5SY85 155 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MDS2Q8NDY4 140 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC25A33Q9BSK2 321 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNFRSF19Q9NS68 423 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLEC5AQ9NY25 188 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 F2RL2O00254 374 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CECR9P0C854 216 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PMCHL1Q16048 86 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DSCAMO60469 2012 aa18.19■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MGST3O14880 152 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIR2DS2P43631 304 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD39Q53RE8 183 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 C22orf15Q8WYQ4 148 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A1W2PRE2 83 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGKV3-15P01624 115 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 C8orf88P0DMB2 117 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PYYP10082 97 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNRD1Q9P1U0 126 aa18.18■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 C2orf70A6NJV1 201 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD24P25063 80 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUDT10Q8NFP7 164 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR10W1Q8NGF6 305 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR8B3Q8NGG8 313 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUDT11Q96G61 164 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR8B2Q96RD0 313 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCHS1Q96JQ0 3298 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 H0YJW9 148 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CORTO00230 105 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGKV1-16P04430 117 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAS2R45P59539 299 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALKBH2Q6NS38 261 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCSAMQ8N6F7 178 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SGK494Q96LW2 274 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGLC7A0M8Q6 106 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 VWC2LB2RUY7 222 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 M0QZ24 198 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE2G1P62253 170 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBR1Q16650 682 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 C17orf58Q2M2W7 97 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC25A2Q9BXI2 301 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRRM5B3KS81 715 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 VWA1Q6PCB0 445 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 Q6ZT83 130 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR2T6Q8NHC8 308 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MBD6Q96DN6 1003 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSMPQ1L6U9 139 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBLN7Q53RD9 439 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIB1Q96RU8 372 aa18.16■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms