RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 CXorf58Q96LI9 332 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 Q96M66 194 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PECRQ9BY49 303 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PLEKHA2Q9HB19 425 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 MBD2Q9UBB5 411 aa9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 C5orf51A6NDU8 294 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SOCS1O15524 211 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TRBV12-3P01733 135 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 CTRB1P17538 263 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SRPXP78539 464 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TNFRSF9Q07011 255 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 DEFB114Q30KQ6 69 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 RPL39P5Q59GN2 51 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 CTRB2Q6GPI1 263 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SVBPQ8N300 66 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TMEM230Q96A57 120 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 RNF126Q9BV68 326 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 IFNA21P01568 189 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PMP2P02689 132 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 AKR1C4P17516 323 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 BMI1P35226 326 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 KIR2DS2P43631 304 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 BLOC1S1P78537 153 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SMIM8Q96KF7 97 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 NICN1Q9BSH3 213 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 COA4Q9NYJ1 87 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ATG12O94817 140 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 RAB5CP51148 216 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SMCO1Q147U7 214 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 HMGN3Q15651 99 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 EHFQ9NZC4 300 aa8.99□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TMEM218A2RU14 115 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PDCD6O75340 191 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PGAM2P15259 253 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 DEFA5Q01523 94 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 KCTD9Q7L273 389 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SEC22AQ96IW7 307 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SEC11CQ9BY50 192 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 BANF2Q9H503 90 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.98□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 E5RGE8 158 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 BMPR1BO00238 502 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ITGB1BP1O14713 200 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SPRY2O43597 315 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 TUSC2O75896 110 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 SNAPINO95295 136 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 APOA2P02652 100 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 IGKV1-16P04430 117 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 CTXN2P0C2S0 81 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 FOLR2P14207 255 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZWC4 215 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PDPNQ86YL7 162 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 ARV1Q9H2C2 271 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 NSG2Q9Y328 171 aa8.97□□□□□ -0.97
SPC25-201ENST00000282074 C2orf70A6NJV1 201 aa8.96□□□□□ -0.98
SPC25-201ENST00000282074 FAM25EA8MYX2 175 aa8.96□□□□□ -0.98
SPC25-201ENST00000282074 SULT1A2P50226 295 aa8.96□□□□□ -0.98
SPC25-201ENST00000282074 APOC4P55056 127 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms