RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 TCTAP57738 103 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM42Q69YG0 159 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 PGPA6NDG6 321 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 PRSS1P07477 247 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 PCSK4Q6UW60 755 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 ERASQ7Z444 233 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 NIT1Q86X76 327 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 SGK494Q96LW2 274 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 K7ENP7 123 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 WNT9BO14905 357 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 JMJD1CQ15652 2540 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 IGFBP2P18065 325 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 LYPD6Q86Y78 171 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 GNB4Q9HAV0 340 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 WNK1Q9H4A3 2382 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1B0GUS0 222 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM157AC9JC47 383 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 IL18BPO95998 194 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 SELLP14151 372 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 SELENOTP62341 195 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 FBLN7Q53RD9 439 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 JPT1Q9UK76 154 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 TM4SF5O14894 197 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 CA7P43166 264 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 PAX9P55771 341 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM177Q53S58 311 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 ASCL4Q6XD76 172 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 MOB3BQ86TA1 216 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 CHODLQ9H9P2 273 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 NDUFB3O43676 98 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 NMUP48645 174 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR31Q8NA23 367 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 TMPRSS2O15393 492 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 PLP1P60201 277 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 RPL39P5Q59GN2 51 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 Q6ZS49 121 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 LEAP2Q969E1 77 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 TNXAQ16473 311 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 LIPFP07098 398 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 NPSP0C0P6 89 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 HBBP68871 147 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 RAB1CQ92928 201 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 RAB37Q96AX2 223 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 OSTCQ9NRP0 149 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 CALYQ9NYX4 217 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 PRNTQ86SH4 94 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 SMIM12Q96EX1 92 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 DIRC2Q96SL1 478 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-201ENST00000266546 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PRD5 423 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PRF3 423 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PRM7 423 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 HYPMO75409 117 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 STAG3L2P0CL84 134 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 STAG3L3P0CL85 134 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF146Q15072 292 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF726P1Q15940 193 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 OR13A1Q8NGR1 328 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 REG1BP48304 166 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RNF7Q9UBF6 113 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 FABP2P12104 132 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 EFNB3Q15768 340 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CYYR1Q96J86 154 aa9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms