RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CRYBB3P26998 211 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IER3P46695 156 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ICAM4Q14773 271 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM144Q7Z5S9 345 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00862A6NCI5 91 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GATA3P23771 443 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GCHFRP30047 84 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGFL2Q6UWQ7 119 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.09□□□□□ -0.79
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RAMP3O60896 148 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CEACAM4O75871 244 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NAPSAO96009 420 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 G0S2P27469 103 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CD69Q07108 199 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RNF5Q99942 180 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV41A0A0B4J266 112 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MSMBP08118 114 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM219Q86XT9 240 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ISOC2Q96AB3 205 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPRMQ9NS64 109 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANOS1P23352 680 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FHL1Q13642 323 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SH3BGRL3Q9H299 93 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BET1LQ9NYM9 111 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PTPN13Q12923 2485 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRTN3P24158 256 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRCDQ00LT1 54 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.08□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 K7EM74 188 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NMBP08949 121 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C2orf68Q2NKX9 166 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6ZN92 141 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PSMB11A5LHX3 300 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DANCRP0C864 163 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PTTG1IPP53801 180 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PVRIGQ6DKI7 326 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q5BKY6 102 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR52E5Q8NH55 327 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SGK494Q96LW2 274 aa10.07□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PLXNA2O75051 1894 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 APCSP02743 223 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LDLRAD4O15165 306 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UQCRFS1P47985 274 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRSS8Q16651 343 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6P435 159 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 M0R2Z0 102 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 COQ2Q96H96 371 aa10.06□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EFNB3Q15768 340 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MPTX1A8MV57 137 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HLA-DRB1P01911 266 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CD99P14209 185 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WISP1O95388 367 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GATA4P43694 442 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TFF3Q07654 80 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HEATR5AQ86XA9 2040 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RNF125Q96EQ8 232 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C18orf12Q96KH6 178 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q96MF0 132 aa10.05□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRGC1P0CF51 173 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PMS2P11Q13670 270 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGLV1-44P01699 117 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MT-ND6P03923 174 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SAA4P35542 130 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HERVK_113P61574 105 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GPR82Q96P67 336 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VAMP8Q9BV40 100 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CKS2P33552 79 aa10.04□□□□□ -0.8
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CD81P60033 236 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms