RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 F8W036 122 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 NPFFO15130 113 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 YIF1AO95070 293 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV1-40P01703 118 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 SFTA3P0C7M3 94 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM106CPP0CH98 169 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 GATA3P23771 443 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 BRS3P32247 399 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 GAMTQ14353 236 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 LCN15Q6UWW0 184 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 SVBPQ8N300 66 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 PERPQ96FX8 193 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC35E1Q96K37 410 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRK2Q5S007 2527 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PRD5 423 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PRF3 423 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PRM7 423 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 A1L4Q6 167 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 B4DSR2 109 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 FCN1O00602 326 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 IFNA1P01562 189 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 MSMBP08118 114 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 BCL2P10415 239 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 B2MP61769 119 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 ICAM4Q14773 271 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 PLGLAQ15195 96 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 LCE3BQ5TA77 95 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 MIC13Q5XKP0 118 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 SSX7Q7RTT5 188 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 THAP8Q8NA92 274 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 C1RLQ9NZP8 487 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 AKAP6Q13023 2319 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC1-201ENST00000229304 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A096LNT2 108 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GV50 99 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV1-69P01742 117 aa7.58□□□□□ -1.2
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APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00869P0C866 280 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 SAA4P35542 130 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 PPT1P50897 306 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFA5Q01523 94 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 HES1Q14469 280 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 HNF4GQ14541 408 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 STPG3Q8N7X2 389 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 C17orf50Q8WW18 174 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB24Q969Q5 203 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 RARRES2Q99969 163 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 TNCP24821 2201 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 COL12A1Q99715 3063 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PPV4 95 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 J3QKU1 62 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 SNAPINO95295 136 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 CNIH1O95406 144 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 PLA2G2AP14555 144 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 AREGP15514 252 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM11P17152 192 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 CTRB1P17538 263 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 OR10J1P30954 320 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMB3P49720 205 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 MFAP2P55001 183 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 SELENOTP62341 195 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 GNB1P62873 340 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 CX3CL1P78423 397 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 FXYD3Q14802 87 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 MLANAQ16655 118 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 GUCA2BQ16661 112 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 HAGHQ16775 308 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.57□□□□□ -1.2
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