RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 TJP1Q07157 1748 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SCN9AQ15858 1988 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 LINC01590Q5TEZ4 76 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 C12orf77C9JDV5 145 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 H3BUT2 72 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SCN1AP35498 2009 aa11.5□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SRP19P09132 144 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 GLRXP35754 106 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 PAX1P15863 534 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 PAX2Q02962 417 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TFF3Q07654 80 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ESPL1Q14674 2120 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 CDK2AP2O75956 126 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TIAF1O95411 115 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.49□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHMP01871 453 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ATP5G3P48201 142 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ALS2Q96Q42 1657 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TM4SF5O14894 197 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SAP30O75446 220 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMEM54Q969K7 222 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM216BQ8N7L0 139 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 MSGN1A6NI15 193 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 UCP1P25874 307 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 LEPP41159 167 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SCN7AQ01118 1682 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.48□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 CECR9P0C854 216 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 CD33P20138 364 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ASCL4Q6XD76 172 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 DTX2Q86UW9 622 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 GDF15Q99988 308 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 HIGD1CA8MV81 97 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 CTSBP07858 339 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 Q5PR19 223 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 C17orf98A8MV24 154 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 CD7P09564 240 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 RFPL3SP0C7P2 107 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SFTA2Q6UW10 78 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 Q9H3A6 140 aa11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 A0A087WWC5 75 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV4-39P01824 125 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 MYOD1P15172 320 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 RNF182Q8N6D2 247 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 NRN1Q9NPD7 142 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 SRD5A1P18405 259 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.46□□□□□ -0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRIP11Q15643 1979 aa11.46□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.46□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 ST20Q9HBF5 79 aa11.46□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZP1P60852 638 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 ASCL2Q99929 193 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF585BQ52M93 769 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 SERF1AO75920 110 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 ERVK11-1P61568 191 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 TM2D1Q9BX74 207 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 LAMA4Q16363 1823 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 CD24P25063 80 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 PLNP26678 52 aa11.45□□□□□ -0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms