RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	TBP	P20226	339 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	UCP3	P55916	312 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TAS2R31	P59538	309 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TNFSF12	O43508	249 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	GPR183	P32249	361 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	BAK1	Q16611	211 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZWC4	215 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	UPK2	O00526	184 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	HPRT1	P00492	218 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TAS2R19	P59542	299 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF585B	Q52M93	769 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	THYN1	Q9P016	225 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TSPAN4	O14817	238 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	NQO2	P16083	231 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	BMI1	P35226	326 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	FXYD4	P59646	89 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CATR1	Q13166	79 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	OR2C3	Q8N628	320 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	ATP6V0B	Q99437	205 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0J9YWU9	116 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TGOLN2	O43493	480 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	RAB3D	O95716	219 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	APOC4	P55056	127 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	LYG2	Q86SG7	212 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM17	Q86X19	198 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2C	O00762	179 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	SPRY2	O43597	315 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	S1PR2	O95136	353 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1-39	P01597	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1D-39	P04432	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	S100A5	P33763	92 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	RND3	P61587	244 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	WT1-AS	Q06250	92 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CADM3	Q8N126	398 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	GPR31	O00270	319 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CYB5B	O43169	146 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	LY6G6C	O95867	125 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	SERPINE2	P07093	398 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	BTC	P35070	178 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	MFAP2	P55001	183 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	HERV-K104	P61576	105 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.3	□□□□□ -0.76

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