RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM131Q92545 1883 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ATAD5Q96QE3 1844 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0A6YYD4 124 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0D9SFI3 127 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FAM220BPB1ANY3 271 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 F6UB75 175 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1D-16P01601 117 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TRGC2P03986 189 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FCGR3AP08637 254 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 P0DMU3 169 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FAM231AP0DMU4 169 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FAM231CP0DMU5 169 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 SEC11AP67812 179 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DRB3P79483 266 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 C10orf111Q8N326 155 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF441Q8N8Z8 693 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR4X2Q8NGF9 303 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 ELSPBP1Q96BH3 223 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 NMNAT3Q96T66 252 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 RTL8AQ9BWD3 113 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 NUDT4Q9NZJ9 180 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 MROH2AA6NES4 1674 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 FMN2Q9NZ56 1722 aa2.42□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 IZUMO1RA6ND01 250 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 C8orf87E5RJ46 101 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 LY6LH3BQJ8 138 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 GABARAPH6UMI1 98 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 J3QT63 122 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 XKRYO14609 159 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 UQCRQO14949 82 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
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