RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560538.1

GATM-211, Transcript of glycine amidinotransferase, humanhuman

TSL 3

Gene GATM, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATM-211ENST00000560538 COQ8AQ8NI60 647 aa6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 ENKURQ8TC29 256 aa6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 MS4A10Q96PG2 267 aa6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 TP53RKQ96S44 253 aa6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GATM-211ENST00000560538 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 FAM223BA6NKX1 122 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 NDUFB6O95139 128 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 CDS2O95674 445 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 IFNA21P01568 189 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 APELAP0DMC3 54 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 PSMB8P28062 276 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 MYCNOSP40205 109 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 CCR6P51684 374 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 KRTAP10-3P60369 221 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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GATM-211ENST00000560538 ATP5G2Q06055 141 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 NOXA1Q86UR1 476 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 GALNT14Q96FL9 552 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SEC22AQ96IW7 307 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 NEU1Q99519 415 aa6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 A0A0B4J2A0 478 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 C15orf61A6NNL5 157 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SCGB2A1O75556 95 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 UPK1BO75841 260 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 BRI3O95415 125 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 OR8U8P0C7N1 319 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 OR13C7P0DN81 318 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 PSMB6P28072 239 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 OR2B8PP59922 312 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 CFHR3Q02985 330 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 ZNF429Q86V71 674 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 NECAP1Q8NC96 275 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 CXorf58Q96LI9 332 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.88□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 HMX3A6NHT5 357 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 CCL24O00175 119 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 MED6O75586 246 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SFT2D2O95562 160 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 ZP3P21754 424 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 GCSHP23434 173 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SPCS3P61009 180 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 RHOGP84095 191 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 NHLH2Q02577 135 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 ZNF616Q08AN1 781 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 ASAH1Q13510 395 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 TMEM187Q14656 261 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 OR1S1Q8NH92 325 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 NSG2Q9Y328 171 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 DNHD1Q96M86 4753 aa6.87□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.86□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 A0A1B0GU03 582 aa6.86□□□□□ -1.31
GATM-211ENST00000560538 LINC01619G3V211 115 aa6.86□□□□□ -1.31
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