RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP10-12P60413 245 aa6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 HLA-DRB3P79483 266 aa6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC42Q9Y546 428 aa6.08□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAT1Q14517 4588 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTL8CO15255 209 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP8B1O43520 1251 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 S1PR2O95136 353 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 BAG2O95816 211 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 LALBAP00709 142 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 C8orf88P0DMB2 117 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLK9Q2XQG4 91 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 C15orf32Q32M92 178 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTNL8Q6UX41 500 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPHB5Q86YW7 130 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDH26Q8IXH8 852 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 NECAP1Q8NC96 275 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF221Q9UK13 617 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 APLNQ9ULZ1 77 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2KP61086 200 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS8Q16651 343 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q499Y3 187 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 APH1BQ8WW43 257 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TM2D1Q9BX74 207 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CKLFQ9UBR5 152 aa6.06□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A0A6YYD4 124 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNTNA6NMZ2 147 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 EPM2AB3EWF7 344 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0R1X1 148 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB25P24278 435 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNGT1P63211 74 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP5G2Q06055 141 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 UNC119Q13432 240 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 THRSPQ92748 146 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 DERL3Q96Q80 235 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 NICN1Q9BSH3 213 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 MFFQ9GZY8 342 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMBNQ9NP70 447 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1B0GW64 132 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 EI24O14681 340 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2J3O76001 311 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTR2CP28335 458 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ETV1P50549 477 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 QRFPP83859 136 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNXAQ16473 311 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 SETD6Q8TBK2 473 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 MARC2Q969Z3 335 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHB2Q99623 299 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC29A1Q99808 456 aa6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms