RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 NAT8Q9UHE5 227 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 J3KRW8 73 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TWIST1Q15672 202 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 Q1RN00 199 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MORN2Q502X0 79 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PSMG4Q5JS54 123 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 NINQ8N4C6 2090 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf94C9JXX5 98 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ADAM10O14672 748 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PRB1P04280 392 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TGFBR1P36897 503 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 IRF3Q14653 427 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 RBKSQ9H477 322 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 RAMP3O60896 148 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 APELAP0DMC3 54 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PLA2G2AP14555 144 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 VOPP1Q96AW1 172 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 H3BRM9 83 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV1-44P01699 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 COL8A2P25067 703 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS8Q16651 343 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MST1LQ2TV78 715 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 OR52E5Q8NH55 327 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SGK494Q96LW2 274 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 A0A087WX48 190 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PRNTQ86SH4 94 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 HMSDA8MTL9 139 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 GCGP01275 180 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MT-ND6P03923 174 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 RIPPLY3P57055 190 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 IGSF11Q5DX21 431 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 H0YL77 283 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 CLDN34H7C241 214 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF688P0C7X2 276 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF585BQ52M93 769 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 FAM201AQ5SY85 155 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00311Q8N616 119 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV2-70P01814 119 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV2-5P01817 119 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 OR10C1Q96KK4 312 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 CRYBA2P53672 197 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 GPR132Q9UNW8 380 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 RNF125Q96EQ8 232 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 AICDAQ9GZX7 198 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00587B1AMM8 73 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS1P07477 247 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MPZP25189 248 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.65□□□□□ -1.34
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