RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 COX11Q9Y6N1 276 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 C21orf140B9A014 251 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 C8orf88P0DMB2 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 PTTG1IPP53801 180 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 LOXL3P58215 753 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 OR4A47Q6IF82 309 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 VASH2Q86V25 355 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 ZNF503Q96F45 646 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 GGTLC3B5MD39 225 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 IGKV3-15P01624 115 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 CFHR2P36980 270 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 C2orf83Q53S99 150 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 LRRC29Q8WV35 223 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 OR8B2Q96RD0 313 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 CDH23Q9H251 3354 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 PIEZO1Q92508 2521 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-202ENST00000542324 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SRRM5B3KS81 715 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 OR7C2O60412 319 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 HSBP1O75506 76 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 PRCDQ00LT1 54 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 EDDM3AQ14507 147 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 FXYD3Q14802 87 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SMIM12Q96EX1 92 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 H0YJW9 148 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CCL25O15444 150 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 ACTL6BO94805 426 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CGB3P0DN86 165 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CGB7P0DN87 165 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CD46P15529 392 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CDKN1BP46527 198 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 TCL1AP56279 114 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 UBE2G1P62253 170 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 ARG2P78540 354 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 LTC4SQ16873 150 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 VWA1Q6PCB0 445 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 Q6ZT83 130 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 MUC15Q8N387 334 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 ZNF714Q96N38 554 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CALYQ9NYX4 217 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 UPK2O00526 184 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SPINK4O60575 86 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 TFF1P04155 84 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 NTF3P20783 257 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 TNFSF4P23510 183 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 HOXC12P31275 282 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 RBX1P62877 108 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 TRIB1Q96RU8 372 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 J3QR06 171 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 REG1BP48304 166 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SLAQ13239 276 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 ST20Q9HBF5 79 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 GCM1Q9NP62 436 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 DUSP13Q9UII6 198 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-202ENST00000542324 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms