RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PRTN3P24158 256 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PAX6P26367 422 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRNA7P36544 502 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 MIC13Q5XKP0 118 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF5Q99942 180 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A22Q9H936 323 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 FBN2P35556 2912 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PPI3 338 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SMCO3A2RU48 225 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP92A6NM28 416 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ODF3BA8MYP8 253 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BQ15 152 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFS7O75251 213 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 IFNA1P01562 189 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00869P0C866 280 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 COX7A1P24310 79 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CDKN1AP38936 164 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 EFNA4P52798 201 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR20EP86478 221 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR20CP86479 221 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR20DP86480 221 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR20BP86481 221 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR20AP86496 221 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 WT1-ASQ06250 92 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CD69Q07108 199 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PSG5Q15238 335 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 RHEBQ15382 184 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS8Q16651 343 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 TEPPQ6URK8 271 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PNKDQ8N490 385 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 NRGNQ92686 78 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A17O43808 307 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 GOSR1O95249 250 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 MAS1LP35410 378 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CD81P60033 236 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ARF6P62330 175 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PAX2Q02962 417 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 MOB3BQ86TA1 216 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 MMD2Q8IY49 270 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCA4P78363 2273 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 F8P00451 2351 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 M0R036 132 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV2-5P01817 119 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 STAG3L2P0CL84 134 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 STAG3L3P0CL85 134 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CNTFRP26992 372 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 HTR1DP28221 377 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 AKR1C3P42330 323 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMB3P49720 205 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB31Q13636 194 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 GAMTQ14353 236 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 MLANAQ16655 118 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.65□□□□□ -1.02
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