RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 PF4P02776 101 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 P0C879 139 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 ERHP84090 104 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 RHOGP84095 191 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 PRCDQ00LT1 54 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZRM9 215 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF429Q86V71 674 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.44□□□□□ -0.74
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PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.44□□□□□ -0.74
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PGGT1B-204ENST00000503638 ADAP1O75689 374 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2J3O76001 311 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 TSPAN15O95858 294 aa10.43□□□□□ -0.74
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PGGT1B-204ENST00000503638 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 LRTM2Q8N967 370 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 DUX3Q96PT4 197 aa10.43□□□□□ -0.74
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PGGT1B-204ENST00000503638 GNB4Q9HAV0 340 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GU03 582 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 SPNP16150 400 aa10.42□□□□□ -0.74
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PGGT1B-204ENST00000503638 SPCS3P61009 180 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP5G2Q06055 141 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 RGS21Q2M5E4 152 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A24Q6NUK1 477 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF491Q8N8L2 437 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF152Q8N8N0 203 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.42□□□□□ -0.74
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PGGT1B-204ENST00000503638 MISP3Q96FF7 219 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2E2Q96LR5 201 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CACFD1Q9UGQ2 172 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD34BA5PLL1 514 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 C5orf51A6NDU8 294 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM223BA6NKX1 122 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CCSO14618 274 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 SSNA1O43805 119 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 PRAF2O60831 178 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 SCGB1D2O95969 90 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CTRB1P17538 263 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 C15orf32Q32M92 178 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 NECAP1Q8NC96 275 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 DPF1Q92782 380 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 USMG5Q96IX5 58 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 HIPK2Q9H2X6 1198 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 THYN1Q9P016 225 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 GSKIPQ9P0R6 139 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 S4R3C0 116 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 WRBO00258 174 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-23P01764 117 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 IL5P05113 134 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CRYGCP07315 174 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFRSF9Q07011 255 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 RBKSQ9H477 322 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa10.39□□□□□ -0.75
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PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFB8O95169 186 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR31Q5SQ13 230 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2C3Q8N628 320 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1L6Q8NGR2 347 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1N2Q8NGR9 330 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 OR52E5Q8NH55 327 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 DTD1Q8TEA8 209 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 P2RX4Q99571 388 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGT1Q9H0U3 335 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 MPTX1A8MV57 137 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 GOSR2O14653 212 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 MED6O75586 246 aa10.38□□□□□ -0.75
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