RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 OPN1MWP04001 364 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 NMBP08949 121 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM157CP0CG43 387 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM106CPP0CH98 169 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SPP1P10451 314 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 NPY1RP25929 384 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PAX6P26367 422 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.57□□□□□ -1.04
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ECHDC3-204ENST00000495787 TNXAQ16473 311 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf83Q53S99 150 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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ECHDC3-204ENST00000495787 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF141Q8WVD5 230 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 GGACTQ9BVM4 153 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 E7EUB6 86 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FGF16O43320 207 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM11P17152 192 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CD24P25063 80 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP6V0CP27449 155 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SULT1A2P50226 295 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 DLK1P80370 383 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PLGLAQ15195 96 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 VWC2Q2TAL6 325 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 BSXQ3C1V8 233 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.56□□□□□ -1.04
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ECHDC3-204ENST00000495787 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 C1RLQ9NZP8 487 aa8.56□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1B0GW64 132 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PRSS46E5RG02 174 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TGFAP01135 160 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 IFNA4P05014 189 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SNCAP37840 140 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 BPIFB3P59826 476 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.55□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FNDC10F2Z333 226 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FCN1O00602 326 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP6V1G1O75348 118 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 AVPP01185 164 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 OR13C7P0DN81 318 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB5CP51148 216 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 GNB1P62873 340 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 BLOC1S1P78537 153 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 WT1-ASQ06250 92 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FBLN7Q53RD9 439 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 MED9Q9NWA0 146 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PLXNB1O43157 2135 aa8.54□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0U1RQK1 487 aa8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TEX22C9J3V5 150 aa8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 UMAD1C9J7I0 102 aa8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM77I1YAP6 450 aa8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CNIH1O95406 144 aa8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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